Joo Ji Hoon fue acusado por consumo de drogas. El 23 de junio de 2009 se dicto sentencia a un año de libertad vigilada y 120 horas de servicios comunitarios, además del pago de 360.000 won (unos 260€) aunque es un duro castigo, se ha rebajado la petición de la fiscalía de 1 año de cárcel.
Decidió solicitar su entrada al servicio militar obligatorio, ya que no contaba con la edad para ingreso. En febrero del 2010 ingresó al servicio militar.
En enero 2011 firmo contrato con KEYEAST y así regresar al mundo de la actuación, una vez que termine su servicio militar.
El 21 de noviembre 2011, concluyó sus dos años de servicio militar obligatorio. Más de 500 fans le ofreció una gran bienvenida a la vida civil.
Es cercano a Eunjung de T-ARA desde que ella hizo apariciones en Goong. También actuaron juntos en el drama Five Fingers pero las escenas de Eunjung fueron eliminadas de la transmisión pública. Ambos participaron en el festival de filme de Busan como MCs.
Dos semanas antes de estrenar el musical Dr. Zhivago tuvo que retirarse del mismo, ya que sus cuerdas vocales se vieron afectadas y sus médicos le aconsejaron retirarse.
Junto a Bae Yong Joon y otros invitados participan en el Memorial del album "Winter Sonata Anime". El mismo consta de un CD y un DVD. Joo Ji Hoon tendra tres participaciones en el mismo.
El 09 de mayo de 2014 su agencia confirmo que esta en una relación con Ga In de Brown Eyed Girls, los dos comenzaron a salir hace apenas un mes. Ambos han mantenido una relacion de amistad por mas de ocho años.
Tras los informes de la ruptura de Ga In y Joo Ji Hoon, ambas partes han confirmado que la noticia es cierta.Keyeast Entertainment y Mystic Entertainment dijeron el 7 de julio de 2017: “Es cierto que Ga In y Joo Ji Hoon han terminado. Les pedimos su comprensión de que cualquier detalle adicional es un asunto privado, por lo que es difícil para nosotros decir más”.