Rostro publicitario para una campaña en Corea contra la corrupción.
En febrero 14 de 2009, se supo que sostenía una relación desde hacia dos años con la actriz Choi Ji Woo mayor por 6 años
El 6 de mayo del 2009 ingresó a realizar su servicio militar obligatorio durante 2 años, y volvio en 7 de marzo de 2011.
El 28 de Mayo de 2014, se ha confirmado que esta en una relación con la actriz Gong Hyo Jin, llegaron a conocerse a través de una reunión entre personas de la industria del cine y se convirtieron rápidamente cercanos ya que ambos son modelos de actores convertidos y tiene una pasión por la moda. Después de sus intereses similares, los dos fueron vistos en marzo del año pasado en un desfile de moda juntos. Ambos están siendo llamado una "Pareja visual", debido a sus figuras como modelo y estilo de moda.
Las agencias de talento que representan a los actores Gong Hyo Jin y Lee Jin Wook han confirmado que la pareja no está más junta. Las agencias respondieron los informes que habían surgido anteriormente alegando que la pareja había terminado su relación.La agencia de Lee Jin Wook, Will Entertainment, declaro a los medios: “Ellos han decidido continuar con su relación profesional, continuaran mostrándose apoyo”. La agencia agregó: Por favor continúen apoyando a ambos en los proyectos que ellos continúen”.
El 15 de julio de 2016, una fuente cercana a la policía reveló que una mujer de unos 30 años presentó una demanda el cual acuso a Lee Jin Wook de asalto sexual el 14 de julio.
Tras varias investigaciones el actor ha quedado libre de toda sospecha de las acusaciones de asalto sexual formuladas contra él a mediados del pasado mes, mientras que la demandante, está siendo investigada por difamación.